中国药物化学杂志

2001, (04)

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喜树碱构象的量子化学研究及其与晶体结构的比较
Conformational Analysis of Camptothecin Using the Quantum Chemical Methods and Comparison with the X-ray Structure

宋云龙,张万年,季海涛,周有骏,朱驹,吕加国

摘要(Abstract):

喜树碱类抗肿瘤药物是临床广泛使用的经典的作用于DNA拓扑异构酶Ⅰ的特异性抑制剂。已有的喜树碱构象研究结果彼此并不一致 ,而采用可靠方法进行构象研究是阐明该药物作用模式的关键一环。本文在分子动力学搜寻喜树碱构象空间的基础上 ,采用量子化学的半经验AM1、PM3方法和abinitio的RHF/3 2 1G、RHF/6 3 1G方法对近似晶体结构构象的分子力学构象进行了系统优化。所得构象均采用密度泛函方法B3LYP/6 3 1G(d)进行单点能计算 ,并和喜树碱碘乙酸酯的晶体结构进行了比较。结果表明 ,abinitio方法得到的构象更接近晶体结构构象 ,而半经验方法得到的构象接近初始的分子力学构象。abinitio方法研究表明喜树碱E环内酯部分形成分子内氢键 ,使E环内酯键反应性提高 ,可与TopoI-DNA共价复合物形成较好的相互作用 ,同时又使喜树碱易受溶剂水的影响而开环失去活性

关键词(KeyWords): 喜树碱;拓扑异构酶Ⅰ;分子构象;分子内氢键

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): “973”国家重点基础研究项目子项目 (G1 9980 5 1 1 0 4 );; 国家自然科学基金项目 (3 9970 874 )

作者(Author): 宋云龙,张万年,季海涛,周有骏,朱驹,吕加国

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